Mizuho Nishikubo nasce a Tokyo nel 1953. Esordisce nell’animazione nel 1975,e nel 1979 diventa uno dei principali collaboratori di Osamu Dezaki, uno dei più famosi e rispettati registi allora in attività, col quale lavora a classici come Lady Oscar e Rocky Joe. Il suo debutto come regista avviene nel 1985 con la commedia romantica Miyuki, alla quale seguono altri anime noti anche in Italia come Video Girl Ai.
Dal 1993 inizia a lavorare con Mamoru Oshii, col quale collabora a tutti i film a partire da Patlabor 2. Giovanni’s Island (in programma venerdì 30 ottobre alle 12.00 al Cinema Centrale), vincitore di molti premi internazionali, è il suo secondo lungometraggio.